为探明甘蔗鞭黑粉菌不同致病力菌株在转录水平的差异，挖掘致病相关基因，采用Illumina测序技术对2个不同致病力菌株Ss16（强致病力）和Ss47（弱致病力）构建cDNA文库，进行转录组测序，通过质控后对其进行生物信息学分析。结果显示：共获得8.31G（Ss16）和9.88G（Ss47）的分析数据（clean reads），Ss16和Ss47相比较共获得显著（P＜0.05）差异表达基因649个，其中上调基因299个，下调基因350个。差异性表达基因的GO注释及KEGG通路富集分析结果表明，KEGG通路多与物质的蛋白合成、运输和代谢相关，富集最显著的前几条通路分别为：淀粉和蔗糖代谢（starch and sucrose metabolism）、ABC转运蛋白（ABC transporters）、芳香族化合物的降解（degradation of aromatic compounds）、代谢途径（metabolic pathways）和嘌呤代谢（purine metabolism）。